Nella stagione 2006-2007 il Grosseto disputa il girone A del campionato di Serie C1, con 62 punti lo vince salendo per la prima volta nella sua storia in Serie B. Dopo un girone di andata discreto, con 24 punti raccolti, che è stato chiuso a metà classifica, con il tecnico Massimiliano Allegri sostituito alla 10ª giornata, il Grosseto è stato poi protagonista, con alla guida Antonello Cuccureddu, di un girone di ritorno eccellente, nel quale ha raccolto 38 punti, chiudendo la stagione con lo Stadio Zecchini inviolato in campionato, ma soprattutto con un punto in più del Sassuolo. Salendo così direttamente in Serie B, ed evitando le trappole dei Play-off, nelle quali è invece incorso il Sassuolo, che ha perso la semifinale dei Play-off contro il Monza, che a sua volta perde la finale contro il Pisa, promosso con il Grosseto. Il napoletano Giovanni Cipolla con 15 reti è stato il miglior marcatore biancorosso di questa stagione. La festa promozione arriva il 13 maggio a Padova, con la vittoria (0-1) sui biancoscudati. Nella Coppa Italia Nazionale il Grosseto esce nel primo turno eliminato dal Piacenza, che si è imposto con un pirotecnico (3-4). Nella Coppa Italia di Serie C entra in scena negli Ottavi, avendo partecipato a quella nazionale, ma viene eliminato nel doppio confronto dal Teramo.