SLC22A6

SLC22A6
Ідентифікатори
Символи	SLC22A6, HOAT1, OAT1, PAHT, ROAT1, Organic anion transporter 1, solute carrier family 22 member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 607582 MGI: 892001 HomoloGene: 16813 GeneCards: SLC22A6
Реагує на сполуку
	пробенецид, pratosartan
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0022891 transmembrane transporter activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • inorganic anion exchanger activity; • chloride ion binding; • organic anion transmembrane transporter activity; • urate transmembrane transporter activity; • sodium-independent organic anion transmembrane transporter activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • basolateral plasma membrane; • caveola; • екзосома; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• response to methotrexate; • renal tubular secretion; • anion transport; • alpha-ketoglutarate transport; • organic anion transport; • protein homooligomerization; • anion transmembrane transport; • inorganic anion transport; • трансмембранний транспорт; • urate transport; • sodium-independent organic anion transport; • organic acid transmembrane transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9356
	18399
	ENSG00000197901
	ENSMUSG00000024650
	Q4U2R8
	Q8VC69
	NM_153279; NM_004790; NM_153276; NM_153277; NM_153278
	NM_008766
	NP_004781; NP_695008; NP_695009; NP_695010
	NP_032792
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SLC22A6 (англ. Solute carrier family 22 member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 61 816^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFNDLLQQV	GGVGRFQQIQ	VTLVVLPLLL	MASHNTLQNF	TAAIPTHHCR
PPADANLSKN	GGLEVWLPRD	RQGQPESCLR	FTSPQWGLPF	LNGTEANGTG
ATEPCTDGWI	YDNSTFPSTI	VTEWDLVCSH	RALRQLAQSL	YMVGVLLGAM
VFGYLADRLG	RRKVLILNYL	QTAVSGTCAA	FAPNFPIYCA	FRLLSGMALA
GISLNCMTLN	VEWMPIHTRA	CVGTLIGYVY	SLGQFLLAGV	AYAVPHWRHL
QLLVSAPFFA	FFIYSWFFIE	SARWHSSSGR	LDLTLRALQR	VARINGKREE
GAKLSMEVLR	ASLQKELTMG	KGQASAMELL	RCPTLRHLFL	CLSMLWFATS
FAYYGLVMDL	QGFGVSIYLI	QVIFGAVDLP	AKLVGFLVIN	SLGRRPAQMA
ALLLAGICIL	LNGVIPQDQS	IVRTSLAVLG	KGCLAASFNC	IFLYTGELYP
TMIRQTGMGM	GSTMARVGSI	VSPLVSMTAE	LYPSMPLFIY	GAVPVAASAV
TVLLPETLGQ	PLPDTVQDLE	SRWAPTQKEA	GIYPRKGKQT	RQQQEHQKYM
VPLQASAQEK	NGL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Reid G., Wolff N.A., Dautzenberg F.M., Burckhardt G. (1998). Cloning of a human renal p-aminohippurate transporter, hROAT1. Kidney Blood Press. Res. 21: 233—237. PMID 9762842 DOI:10.1159/000025863
Race J.E., Grassl S.M., Williams W.J., Holtzman E.J. (1999). Molecular cloning and characterization of two novel human renal organic anion transporters (hOAT1 and hOAT3). Biochem. Biophys. Res. Commun. 255: 508—514. PMID 10049739 DOI:10.1006/bbrc.1998.9978
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Groves C.E., Munoz L., Bahn A., Burckhardt G., Wright S.H. (2003). Interaction of cysteine conjugates with human and rabbit organic anion transporter 1. J. Pharmacol. Exp. Ther. 304: 560—566. PMID 12538807 DOI:10.1124/jpet.102.043455
Tanaka K., Xu W., Zhou F., You G. (2004). Role of glycosylation in the organic anion transporter OAT1. J. Biol. Chem. 279: 14961—14966. PMID 14749323 DOI:10.1074/jbc.M400197200
Hong M., Zhou F., You G. (2004). Critical amino acid residues in transmembrane domain 1 of the human organic anion transporter hOAT1. J. Biol. Chem. 279: 31478—31482. PMID 15145940 DOI:10.1074/jbc.M404686200

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Solute carrier family 22 member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10970 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q4U2R8 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Solute carrier family 22 member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10970 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q4U2R8 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]