Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXG1
Ідентифікатори
Символи
FOXG1 , BF1, BF2, FHKL3, FKH2, FKHL1, FKHL2, FKHL3, FKHL4, FOXG1A, FOXG1B, FOXG1C, HBF-1, HBF-2, HBF-3, HBF-G2, HBF2, HFK1, HFK2, HFK3, KHL2, QIN, forkhead box G1
Зовнішні ІД
OMIM : 164874 MGI: 1347464 HomoloGene: 3843 GeneCards: FOXG1
Пов'язані генетичні захворювання
синдром Ретта [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0010260 старіння людини • brain development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuroblast proliferation • regulation of mitotic cell cycle • dorsal/ventral pattern formation • регуляція експресії генів • axon midline choice point recognition • pyramidal neuron migration to cerebral cortex • central nervous system neuron development • cerebral cortex development • Нейрогенез • forebrain development • inner ear morphogenesis • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell cycle • neuron fate determination • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • regulation of cell cycle • regulation of neural precursor cell proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 28.77 – 28.77 Mb
Хр. 12: 49.43 – 49.43 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
FOXG1 (англ. Forkhead box G1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот , а молекулярна маса — 52 352[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLDMGDRKEV KMIPKSSFSI NSLVPEAVQN DNHHASHGHH NSHHPQHHHH
HHHHHHHPPP PAPQPPPPPQ QQQPPPPPPP APQPPQTRGA PAADDDKGPQ
QLLLPPPPPP PPAAALDGAK ADGLGGKGEP GGGPGELAPV GPDEKEKGAG
AGGEEKKGAG EGGKDGEGGK EGEKKNGKYE KPPFSYNALI MMAIRQSPEK
RLTLNGIYEF IMKNFPYYRE NKQGWQNSIR HNLSLNKCFV KVPRHYDDPG
KGNYWMLDPS SDDVFIGGTT GKLRRRSTTS RAKLAFKRGA RLTSTGLTFM
DRAGSLYWPM SPFLSLHHPR ASSTLSYNGT TSAYPSHPMP YSSVLTQNSL
GNNHSFSTAN GLSVDRLVNG EIPYATHHLT AAALAASVPC GLSVPCSGTY
SLNPCSVNLL AGQTSYFFPH VPHPSMTSQS STSMSARAAS SSTSPQAPST
LPCESLRPSL PSFTTGLSGG LSDYFTHQNQ GSSSNPLIH
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Bredenkamp N., Seoighe C., Illing N. (2007). Comparative evolutionary analysis of the FoxG1 transcription factor from diverse vertebrates identifies conserved recognition sites for microRNA regulation. Dev. Genes Evol . 217 : 227—233. PMID 17260156 DOI :10.1007/s00427-006-0128-x
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші